目前国家教育部门并没有公布权威的大学排名榜单，以下是升学报考指南为广大考生整理的第三方机构（软科、校友会）公布的南方医科大学全国排名情况，由于各机构排名指标不一样，排名位次仅供初略参考，不代表权威结果，选择学校时还请综合多方面因素考虑。
1、南方医科大学全国排名【软科版】
| 序号 | 学校名称 | 公布机构 | 公布时间 | 全国排名 |
| 1 | 南方医科大学 | 软科 | 2023 | 医4 |
| 2 | 南方医科大学 | 软科 | 2022 | 医7（75） |
| 3 | 南方医科大学 | 软科 | 2021 | 医6（78） |
| 4 | 南方医科大学 | 软科 | 2020 | 75 |
| 5 | 南方医科大学 | 软科 | 2018 | 77 |
| 6 | 南方医科大学 | 软科 | 2017 | 66 |
2、南方医科大学全国排名【校友会版】
| 序号 | 学校名称 | 公布机构 | 公布时间 | 全国排名 |
| 1 | 南方医科大学 | 校友会 | 2023 | 107* |
| 2 | 南方医科大学 | 校友会 | 2022 | 111 |
| 3 | 南方医科大学 | 校友会 | 2021 | 110 |
| 4 | 南方医科大学 | 校友会 | 2020 | 95 |
| 5 | 南方医科大学 | 校友会 | 2019 | 120 |
| 6 | 南方医科大学 | 校友会 | 2018 | 114 |
| 7 | 南方医科大学 | 校友会 | 2017 | 117 |
| 8 | 南方医科大学 | 校友会 | 2016 | 112 |
3、南方医科大学简介
南方医科大学（Southern Medical University）前身为中国人民解放军第一军医大学，创建于1951年，1979年确定为全国重点大学，2004年8月整体移交广东省，更名南方医科大学。
广东省高水平大学重点建设高校中唯一的医学院校，全国首批、广东唯一一所教育部、国家卫生健康委员会与广东省共建高校，首批开设八年制本硕博连读临床医学专业的8所高校之一，首批卓越医生教育培养计划试点高校，唯一开设八年制医学教育的独立医科院校，中国政府奖学金来华留学生接收院校，入选国家"特色重点学科项目"、国家建设高水平大学公派研究生项目、广东省"211工程"、国家创新人才培养示范基地、国家国际科技合作基地，CDIO工程教育联盟成员。
